La Fundación nace por solicitud de la propia Alejandra una niña que fue diagnosticada con leucemia a los 7 años y murió de dicha enfermedad a la edad de 14 años en 1992 (34 años). Ella le pidió como su ultima voluntad y deseo a su madre Isabel Mejia de Vélez que ayudara a los niños con cáncer y sus familias que enfrentan esta dura situación y pasan por grandes necesidades.

Al año siguiente Isabelita Mejía de Vélez en compañía de su esposo Jorge Eduardo Vélez Arango y su hija Mariana, otros miembros de su familia y amigos cercanos fundaron y crearon la Fundación Alejandra Vélez Mejía para niños con leucemia y otros tipos de cáncer. La Fundación viene ayudando y apoyando a los niños con cáncer y sus familias desde hace 33 años.

Su personería jurídica se registró en la gobernación de Caldas hace 30 años en febrero de 1996.